Наполнение производится через обратимые гидроагрегаты Кубанской гидроаккумулирующей электростанции (ГАЭС), при этом она работает в генераторном режиме и вырабатывает электроэнергию.

Сейчас в Большой Ставропольский канал из реки Кубань подаётся порядка 120 кубометров воды в секунду, к ГАЭС поступает 111 кубометра в секунду. Из них 38 идёт через ГАЭС на наполнение Кубанского водохранилища, а 73 кубометра проходит дальше по каналу к станциям Каскада Кубанских ГЭС и другим водопользователям, а затем возвращается в реку Кубань.

В режиме выработки электроэнергии ГАЭС будет работать до конца августа, пока в водохранилище не наберется 474,8 миллионов кубических метров воды. Накопленная вода будет расходоваться с сентября 2023 до мая 2024 года в интересах всех водопользователей, в том числе нижележащими гидростанциями Каскада Кубанских ГЭС.

Гидроэлектростанции Каскада расположены на Большом Ставропольском и Невинномысском каналах. Вода из реки Кубань подается в каналы зарегулированным потоком через шлюзы-регуляторы.

В этом году, половодье на реке Кубань началось 8 мая. По данным Росгидромета запасы снега в горах Северного Кавказа составили 70-80 % от среднемноголетних значений. Содержание влаги в снеге на уровне нормы. График заполнения Кубанского водохранилища будет корректироваться в соответствии с погодными условиями.
Кубань, которая берёт начало на западном склоне горы Эльбрус и собирает сток с площади одиннадцать тысяч квадратных километров, течёт по территории Карачаево-Черкесии, Ставропольскому краю, Краснодарскому и впадает в Азовское море. Забор воды из реки Кубань производится по двум каналам — Большому Ставропольскому и Невинномысскому. По этим каналам, на которых и расположены гидроэлектростанции каскада, снабжаются так же водопользователи (промышленное, бытовое водоснабжение Карачаево-Черкесской Республики и Ставропольского края, обводнительно-оросительные системы Ставропольского края, Карачаево-Черкесии и Ростовской области).